2020an Shinto Teito bezala aitortutako Tokion, Minato Sahashi 19 urteko gaztea oso adimentsua da, baina presioari aurre egiteko ezintasuna dela eta, unibertsitatera sartzeko proba bi aldiz huts egin du.
Minato-k Musubi izeneko neska bat ezagutuko du, egun batean zerura erortzen dena. Minato-k laster jakingo du "Sekirei" bat dela, bere "Ashikabi" bezala aukeratu zuena, sekirerekin akordioa sortzeko gai den norbaitek jasotako ezaugarria duten talde kriptikoen artean. Horrek ahalmen osoa erabiltzeko aukera ematen die beste Sekirei-rekin gatazkak kentzeko eta Sekirei lotzen dio. 108 neska maitagarriek, emakume bikainek eta bish? Nenek osatzen dute Sekirei bataila Hiroto Minakak, MBI Corporation misteriotsu eta indartsuaren sortzaileak, sortutako "Sekirei Plana" izeneko lehiaketan.
Minato-k laster jakingo du emakumearen ezkontidea izatea ez dela dibertigarria eta jolasak, batez ere beste hainbat Sekireik aukeratzen dutenean, bakoitzak berekin Ashikabi gisa tratua osatuz. Orain, Minato-k Sekirei Planeko bizitza arriskuan jartzen duten gatazkak eta bere lagunek berarekin duten lehia bizia bizitzeko metodo bat aurkitu beharko luke.
Sekirei pertsona baten moduko beste kode bat erabiltzen duten izaki potentzia handikoak dira. Sekirei ontzi espaziala Lurrean erori zen 1999an Kamikura uhartean, eta bi ikaslek aurkitu zuten, Hiroto Minaka (MBIko presidente potentziala) eta Takami Sahashi (MBI ikerlari potentziala eta Minatoren ama). Ontzian, bikoteak 108 bizitza forma aurkitu zituen, "Zutabe bat eta 107 hegazti haur" bezala azalduta.
